吉原先生，

SQS開発者/金子研究室で研究員をしている，
久保と申します．はじめまして．

ご指摘の不具合は，SourceEditor2005のバグに
よるものです．比較的新しいJREを用いた場合に，
PDFなどを生成したものをWebブラウザで表示しようと
すると，NullPointerException というエラーが
発生するものと思います(以前の古い版のJREでは，
このエラーは発生しませんでした)．

現在、この問題への対策をした，
最新版のSourceEditor, MarkReaderを開発中です．
申し訳ありませんが，しばらくお待ちください．
(9月上旬ごろにリリース予定です)

なお，このWebブラウザ連携機能以外の部分は，
問題なく動作しており，目的のファイルの
生成処理自体は，内部的に正常に完了しています．
つまり，別途，手動で，目的のファイルを表示・
利用することは可能です．

この問題の回避策は，当面，次のような
手順となります．

(1)SourceEditor2005のメニューバーの
「ファイル」メニューから，「書き出し」を
実行することで，PDFファイルの書き出しを
行う．

(2)その後，内容の確認をするには，
Acrobat上で書き出したPDFファイルを
手動で，開き直す．

以上のように，手数のかかる形となってしまいますが，
当面，この方法でお願いいたします．